Bei dieser Form liegt dem Schwitzen eine Erkrankung zu Grunde und das Schwitzen ist nur ein Symptom dieser Grunderkrankung. Die Patienten schwitzen vor allem generalisiert, d.h. am gesamten Körper und nicht wie bei der primären Form nur an bestimmten Körperstellen.
Häufige Ursachen sind Störungen des Hormonhaushalts (endokrinologische Ursachen) wie z.B. im Rahmen der Wechseljahre (Menopause) bei der Frau. Auch Störungen der Schilddrüsenfunktion können ursächlich sein. Weiterhin sind neurologische Erkrankungen ein möglicher Auslöser. Auch eine Hyperhidrose durch Einnahme bestimmter Medikamente wird zu den sekundären Formen der Hyperhidrose gerechnet.